Shin志千寻（藤原龙雄饰演）原本继承了剑心刽子手的身份，但被新政府背叛，幸免于难。千寻正在秘密地提出一个可怕的计划来统治日本。大久保去世后，Kenshin深感责任重大，无法推卸责任，于是踏上了自己的旅程。一路上，他不仅遇到了京都的女主角草奈良（拓谷泰丰饰演），还第一次遇到了新宿村和志志雄。与此同时，Sagara Sanosuke（青木贵族饰品）、Kamiya（武井佐久饰品）、Akihiko（赤木凯斗饰品）和Saito I（Educhi Yosuke饰品）也相继赶往京都。在乌云密布的时代，一场席卷全国的风暴正在酝酿。。。这部电影改编自Kazuki Hiroshi的经典漫画。
清静和宰（石来光宏配音）是一个善良而普通的年轻人。他的妹妹清静和叶（能藤美子配音）的去世永远改变了他未来的道路。袭击Heye的是一种被称为“NOVA”的外星实体。
