12个能够自由变形和深度移动的神秘生物,与来自地狱的信使一起,出现在人类领域,并通过居住在人类三姐妹的家中,秘密执行将人类领域变成地狱的计划。14年前,第一架飞机被怀疑是第一种神化形式的觉醒带来了近三次冲击,在世界上引发了前所未有的动荡。之后,前NERV成员,如葛成梅丽(三石琴配音)逃离并建立了Wille,Wille反抗Seele和NERV。