その道中、一行は正体不明のポケモン「プニちゃん」を旅に連れていくのだが、「プニちゃん」は謎の集団・フレア団に狙われていた。 击败了第七道馆的道馆训练家葛吉花后,小智一行人继续以收集齐八枚徽章为目标向映雪市进发。在旅途中,他们遇到了正体不明的绿色生物“小软”(基格尔德·核心)及为其目标而行动的神秘团体“闪焰队”。
受到突如其来的怪兽袭击,地球上的人类几乎灭亡。为了人类最后的希望,由7名女性组成的TEAM·U守护着地球上最后的孩子。 与此同时,因为听到呼唤而从其它宇宙前来的赛罗奥特曼、戴拿奥特曼和高斯奥特曼成功与TEAM·U会合。
第二季STAFF和声优会由原班人马担任,“钉宫之誓”依旧强势走高。 夏天结束后,新学期开始了 许多事物没有任何变化,但是同时也有不少事情逐渐发展着… 池和吉田,绪方和田中之间产生了些许微妙的关系 还有在我身旁,飘逸着长发的夏娜… 但是,这一切似乎有着一丝奇怪的违何感 在我们所不知道的地方,红世之徒再次展开了行动…