人类最终战争后的世界，大地被黑森林所覆盖，人类只能在被结界守护着的少许土地上生存。被病原体入侵的人类只要靠近天然的火身体就会燃烧，而唯一能够安全使用的火只能通过狩猎栖息在黑森林深处的黑色怪兽“炎魔”采集。
在随后的几天里，那些躲在国家政治底层、依靠蓝绿色药丸执行各种绝密任务的特工相继死亡，而负责弄脏双手的前美国空军上校埃里克·贝尔（爱德华·诺顿饰），慢慢地伸出屠刀，躲在暴雪深山中阿拉斯加特工艾伦·克劳斯（杰瑞米·雷纳饰演）的大山里。突如其来的炮火袭击让艾伦意识到了自己所处的危险境地。在接下来的日子里，他不仅要在以前同伴的追捕中生存下来，还要找到为他提供持续体力和智力来源的蓝绿色药丸
某天，他突然被任命为24世纪的组织·时空管理局的队员，并得知了惊人的事实：实际上教科书上记载的历史全部都是虚假，在过去沉睡着比教科书更加有趣的真实历史“真历史”。比如，被称为绝世美女的埃及艳后实际上是名叫克莱夫和帕特拉的相声演员，正义的伙伴桃太郎实际上是比鬼还要像鬼的男人……时夫与队员可怜一同驱使着24台时间飞船前去探索真历史，这24台时间飞船能够通过变身或合体发挥出超常的力量。而阻挡在时夫等人面前的则是时间飞船系列中为人熟知的反派，这一作的反派名叫比玛乔、兹布亚基、铃木，是被世界最大的教科书公司“History Paradise”雇佣来守护遵循教科书的历史的。究竟即将揭晓的历史会是怎样的“真历史”呢？
