不知道多久前,世界各地出现了专门猎杀人类的巨人,可怕的天敌的出现最终导致了人类文明的衰落和逆转。为了防止巨人无休止的狩猎,人类建造了三堵高墙来保护自己,仿佛一百年过去了。年轻的艾伦(三浦春马饰演)厌倦了被监禁。
史前人类和普通人类之间的种族战争已经达到了激烈的阶段。野村的首领死后,吉川(北村一宏饰演)、小田沙也(小田惠莉佳饰演)和濑户富如(鹿濑龙饰)聚集在未知的总部,思考J教授的真实身份。
主人公是马拓,他也是一名无所事事的高中生。他的父亲是一名历史学家,但他在研究期间失踪了,留下他和继母相互依赖。暑假期间,主人公收到了父亲寄来的一个包裹,里面有一个指南针和三颗水晶珠,还有一封写着“时间是可逆的,历史是不可逆转的”的信和一些关于平行世界概念的信。他指示主人公晚上去当地著名的地标性建筑剑点与某人会面。Tuoye按计划在晚上到达剑点,发现他的继母Ayumi和他父亲的研究伙伴Takasami都在场。原本友好的龙藏寺突然转过身来,要求一匹马交出收到的包裹,并拔出枪威胁他。就在关键时刻,一道闪电落下,击中了神社的御神石,导致陀罗昏倒。当拓也醒来的时候,周围没有人。回家睡了一会儿之后,他意识到不对劲。我的继母和龙藏寺都不记得昨晚发生了什么。此刻,他意识到父亲送给他的遗物是一种神奇的道具,可以让人们自由地穿越平行世界。因此,他进行了一系列调查,以找到他父亲的真实下落。