2031年,由于作为下一代能源设备开发的“量子反应堆”的爆炸,世界发生了巨大变化。从地下传播的突然闪光吞没了城市建筑,覆盖了土地,最终,超越并融合了生物学、机械和植物的未知而独特的进化有机体“B.R.A.I”出现了。史前人类和普通人类之间的种族战争已经达到了激烈的阶段。野村的首领死后,吉川(北村一宏饰演)、小田沙也(小田惠莉佳饰演)和濑户富如(鹿濑龙饰)聚集在未知的总部,思考J教授的真实身份。