故事发生在位于关东南部的川神市，春天来临，万物复苏，平凡的少年直江大和（神谷浩史 配音）来到了川神学园，准备在这里开始全新的校园生活。刚刚开学，校园里是一副欣欣向荣的热闹景象，在这里，大和会遇见怎样有趣的伙伴，又会发生怎样有趣的故事呢？ 活泼开朗，古灵精怪的川神百代（浅川悠 配音）、四肢发达，头脑简单的川神一子（友永朱音 配音）、温文尔雅，温柔大方的黛由纪江（后藤邑子 配音）、外冷内热，坚强韧性的椎名京（冰青 配音），心高气傲，绝不认输的克丽丝蒂安妮·弗里德里希（伊藤静 配音），围绕在大和身边的，正是这些性格迥异但同样善良正直的美少女们。
Akai家族是一个危险的家族，每个人都有许多真实身份的谜团和复杂的背景。在濑户假死的联邦调查局探员赤井水一是《名侦探柯南·宏的缺席证明》的中心人物，该书揭示了赤井水一、新闻新一、植田秀树和玛丽的性格以及他们的关系。
与此同时，双胞胎连环杀人事件接连发生，姐妹俩陷入了一个黑暗血腥的谜团；单向街：一位离异的记者带着年幼的女儿去郊区采访一位科幻小说家。随着神秘极光的出现，这位记者似乎进入了一条时间隧道，坠入了一个平行的世界；美丽的护士小璐来到某精神病院工作，那里有各种行为怪异的病人，医院背后也隐藏着令人震惊的秘密
