【異形特攻學園】描述距離現今不遠的未來世界裡，到處都可以看到異星人，人們一點也不覺得稀奇，即使在小學裡…在小學裡每個人都會被分配到不同的工作，像是生活股長、衛生股長、飼育股長，當然也有叫作「異形應變小組」的工作 。
一个叫鸟男的旁观者走进新宿车站附近的一间书店里，偷了几本性科学和人体美术书，被店员梅子扭送到老板处。鸟男在被抓时还在不断的偷，并说“我差一点就要射精了”，被抓后鸟男也丝毫没有认罪的态度。老板对鸟男偷书的选择很赏识，反而拿钱叫梅子陪鸟男上餐厅。两人一起看偷来的书，互相挑逗，当夜作爱，但很不成功。 次日，两人请教性科学家，露骨的关于性爱的讨论和场面不断出现在银幕上，但两人兴趣索然。为刺激性欲，两人去偷看艺妓作爱，这些人为了帮助这两个缺乏性经验的男女，假装要强奸梅子，却假戏真做。深夜，梅子在书店把一本本有趣的书堆起来，每拿一本书，画面就出现作者的肖像，并朗读一段章节。后来。两个人加入了“现场剧院”的“期待扰乱戏剧”，梅子用月经模拟出剖腹的样子。此时，新宿街头的年轻人开始投掷石块。影片最后，反日共派的全日本学生自治会大联合的学生们在反战日袭击了新宿车站。
然而，令人震惊的是，发现学院里的校花菊糖菊居然是一个男性身体！另一方面，为了防止这个秘密被泄露，Ju还与女仆Jasmine联手监视Kanako。灾难性的大学生活开始了
