故事发生在1999年,那个不详的世纪之末。坐落在深山之中,由于不断的发生灵异事件而被称为“超自然学院”的私立学校里,迎来了它年轻强势的新一任校长——神代玛雅(日笠阳子 配音)。电视动画《古坚同学有沟通障碍》第二季的制作决定已经宣布,将于2022年4月播出。她将以高等精灵「葵娜」的身份,在新世界中旅行,尝试调查200年空白期间所发生的事件。