独自居住在东京旧市镇桐山零遇见了明里、日向、桃三姐妹，少年桐山零因此发生了改变……全人类因谜般的现象而在一瞬间石化，之后过了数千年——。 拥有超越人类的头脑，天生的科学少年·千空苏醒了。 “从石器时代到现代文明，要跨越这科学史上的200万年！”。21岁的酒井惠理子（田中丽奈饰）偶然联谊中结识田村（小泽征悦饰），步入情网，并约定在其女友留学归来前交往，一年为限。 片中的舅舅提到，惠丽子家里种植的金盏菊是菊科一年生，一年内盛开枯萎。
