2029年3月某日，某国大使馆遭到一群经大规模义体改造的武装分子的入侵，众多外国使节及其同侪眷属沦为人质，事态十万火急。草薙素子（坂本真绫 配音）召集巴特（松田健一郎 配音）、陀古萨（新垣樽助 配音）等得力属下，并制定了周密的营救计划。
支撑着作品世界的，是存在于人们心中的作品的“回忆”。但每当作品世界被病毒所破坏，作品就会从大家的记忆、回忆当中消除。 我们的战斗，就是为了守护大家与喜爱的作品之间的“重要回忆”！ 在位于秋叶原一角的小小店铺“兔子小屋本铺”工作的12位女孩子的故事。 为了打倒病毒、让秋叶原恢复成曾经的愉快街道，我们正在不断努力！
