宇宙世紀(U.C.)0093年,成為新吉恩總帥的夏亚·阿兹纳布尔對於依然被地球重力所束縛的人類靈魂感到絕望,決心以激烈的手段加以肅正。查知此事的地球聯邦軍王牌駕駛阿姆罗·雷與其所屬的朗德·贝尔艦隊一起與夏亚所領導的新吉恩軍展開最後的決戰...
故事发生在日本关东北部的美南市。它一点也不像年轻人毫无斗志的新太郎昭信二(岛谷直树配音),看似精力充沛但出乎意料的任性福岛龙马(石井隆吉配音),以及拥有超丰富知识库的活字典王储万作(安田路也配音),这四个非常不可靠的高中男生组成了“地球防御部”。尽管它们听起来可能很令人印象深刻,但事实上,每个部门的每个人都无所事事,开着非常悠闲和懒惰的玩笑。一天,在一次意外中,一个名叫卡鲁鲁斯(江口拓配音)的陌生美丽的年轻人意外来到了地球防御部。