与此同时，一年前因战乱而弃国逃亡的瓦爆鲁带着邪恶的魔法师兄弟木修鲁卷土重来，他企图驱逐吴羽，重新统治这片土地。一时间战火重燃，盘桓在此的草帽海贼团被迫卷入其中…… 本片根据日本漫画家尾田荣一郎的同名原著改编，是2008年上映的第九部动画剧场版，也是漫画连载十周年的纪念作品。
在紧张局势持续的同时，两年的邦联首领赢得了年度冠军，一年和两年的盟军诞生了，美利坚合众国和美利坚合众国的联盟之战爆发了。
当芭洛特再次醒来，发现自己正置身于传说中的禁忌科学诞生之地——“乐园”实验室，再次她见识了许多奇怪的发明，并了解到“乐园”和三博士的过去。经过一番追查，她终于得知榭尔（中井和哉 配音）的记忆正藏在卡西诺赌场的一枚筹码之中。为了追查榭尔的过去，芭洛特化装成赌客走入凶险的赌场…… 本片根据冲方丁的科幻小说改编，为“壳中少女”三部曲中第二部（另两部分别为“压缩”和“排气”）。
