在一个魔法消失后的时代,公主阿莱蒂(桑岛法子 配音)独自居住在高高的城堡塔楼里,等待来迎娶她的骑士。而国王为了从众多人选中选出驸马,提出只要谁能将魔法师的宝贝带回来,谁就可以取公主做新娘。时光荏苒,公主每天以书本来消磨时间。
第三季的故事将讲述在前二季动画中,经过前所未有的激烈战斗后第三十届「QUEEN’S BLADE」最终结束。 前任女王,逢魔女王阿尔德拉被打败了,新一任的女王由雷云之将克劳迪特上任。 本身被公认是人格高尚的克劳迪特成为女王之后却性格大变,让整个大陆陷于战火的地狱之中。为了对抗这暴君的暴政及抹去人民的絶望,骑士公主安妮洛特便展开行动,与跟自己结成义姐妹的美斗士一起,扬起叛乱军的正义旗帜。安妮洛特与克劳迪特的战斗就此不可避免地终将展开,喜欢「女皇之刃」系列的大家又可以一睹众美少女战士的英姿了。
身负重伤的斗牙王用天生牙救活被猛丸杀死的爱人,随即与猛丸展开决战。恶战之后,斗牙王生命将终,他命冥加将天生牙和铁碎牙分别赐予杀生丸和犬夜叉,而拥有邪恶强大力量的丛云牙则被永久封印。 数百年后,丛云牙通过食骨井来到现代,并摆脱了封印的束缚。它先控制犬夜叉的身心,回到战国时代与杀生丸展开一番恶战。危难之际,戈薇的力量使丛云牙被迫离开犬夜叉的身体。但它很快又找到新的替身,并且将已化作白骨的刹那猛丸重新召唤回人间,向斗牙王的两个儿子展开报复……