4个普通的年轻人过着得过且过的生活。某天，往学校的途中遇见了不良少年们找碴，被打得落花流水而计画復仇。就在復仇计画实行当天，不良少年们的学校居然因爆炸而陷入一片火海当中，而自己也被当成 爆炸事件嫌疑犯。 「逃」是他们唯一的路。
为了同这股势力抗争，一群名为“舰娘”的女孩子们出现了，在她们的体内，栖息着舰艇之魂，亦是明日呢化身成为各式各样的战舰，为了人类的和平做着不懈的努力。 平日里，舰娘们在名为“镇守府”的大本营里进行日常生活和训练，某日，一位名叫吹雪（上坂堇 配音）的活泼女孩出现在了大家的面前，初来乍到的她踌躇满志，热情满满地加入了舰队的新生活中去，在这里，充满了精彩和刺激的日常就此展开。
