埼玉县新岳谷大学。那年春天，入学的武田永深与儿时的朋友山崎珠姬重聚。高中时，由于没有捕手能够接住永深的球，她变化剧烈的“魔球”无法投出，所以她中途放弃了棒球。但在强队中磨练实力的诸暨，成功接过了永神的变阵球。我年轻时达成的协议实现了。
夜知春亮（梶裕贵 配音）只是一介平凡无奇的少年，就读于私立大秋高中的他过着味同嚼蜡的独生生活。某日夜里，春亮发觉厨房里有不同寻常的响动，本以为家里进了小偷的春亮却意外发现了一个没穿衣服的少女。
然而，Asawa在手术中意外感染了一种神秘的病毒。在西部发生恐怖袭击的同时，远郊的一座大坝发生了爆炸。新宾县刑事警察Tuogusa（由Shinigaki Tsuru配音）传唤了来自饱受战争蹂躏的卡森共和国的大坝管理企业负责人沙特阿拉伯博士。在高级警官的压力下，Togusa没有收到任何有用的信息。另一方面，草剃一方得知了恐怖分子的真实身份，那就是卡尔迪斯的游击队组织。这两起案件之间出乎意料的联系背后的真相是什么？本片改编自十郎政宗的原作，是《攻壳机动队》前传《ARISE》的第三部。
