石松奉命刺杀老大的仇人,最终获罪入狱服刑5年,在狱中结识义友会干部今村幸三(美木良介 饰),结为兄弟。5年时间,泡沫经济令黑帮的生活也举步维艰。出狱后的石松请求泽田给他的妻子志惠子(有森也实 饰)一家夜店,然二人发生误会,石松枪伤泽田,犯下黑社会的大忌,从此开始了黑暗的毁灭之路……
时间来到最终决战的两年后,在本应已迎来和平的地球上,怪兽们再度倾巢而出。 与此同时,世界各地相继发生了各种入侵超古代遗迹的事件。而GUTS-SELECT(精英胜利队)也迎来了新的队长——时冈(中村优一 饰),众人开启了调查。