三好假释的数日后，难波（中谷一郎 饰）被杀，幕后操纵者青木（若山富三郎 饰）转而求助广岛最大的组织海津组。以海津组为后盾，并联合难波组第二代头领野崎（室田日出男 饰），最终逼迫山守组组长（金子信雄 饰）退位。登上顶峰的青木成为众矢之的，险被暗杀开始图谋反击的三好、被迫退位阴谋复辟的山守以及誓为组长报仇的难波组第二代关胜（松方弘树 饰）等人全都伺机而动。一场搅和了阴谋与仁义的黑帮战争即将爆发……
《战国BASARA》中活跃的武将们，在现代高中再次展开了激烈的战斗：前任学生会长“丰臣秀吉”遭到停学处分，学园内群雄割据，为争夺新会长之位成为乱世。
工作室外，二度美的爱妻、店主的妻子方婷正在窥探敬业和志智之间挥之不去的关系。她的嫉妒心越来越强烈，她看到方婷带着怨恨的表情离开了。在深夜获得满足后，他们两人不情愿地分道扬镳。志智乘电梯下了楼，被一个神秘的刺客冲了进来。尽管进行了激烈的斗争，志智最终还是被刺客杀死了
