在亚美斯多利斯期间,爱德华・艾尔利克(朴璐美 饰)和弟弟阿尔方斯(钉宫理恵 饰)遭遇了还有两个月就可以刑满释放的越狱犯梅尔文(森川智之 饰),结果发现对方拥有不输于艾尔利克兄弟的强大炼金术。救了青叶的是名叫弓原雏(早见沙织 配音)的少女,表面上看来她不过是青叶的同班同学,可实际上,雏来自于未来,专程为了保护青叶而潜伏在他的身边。一场意外将青叶和雏带往了未来世界,在那里,青叶亦成为了机体驾驶员,并结识了他一生的挚友迪奥(内山昂辉 配音),在这个充满了危机和战斗的世界中,青叶能够生存下来吗?