在经历了第一季的平淡无奇,第二季的翻天复地后,动画版《魔法先生》第三季终于开学了!第三季全名为《魔法先生 涅吉!~白翼 ALA ALBA~》(魔法先生ネギま!~白き翼 ALA ALBA~),这次涅吉终于带领这帮问题学生平安过渡到初三。
某天,时隔10年回到日本的少年一希东,突然遭到武装男子们的袭击,并被囚禁起来。而救出了东的人,是青梅竹马的少女朝吹黄金,以及有着右手形态、拥有意志的武器“舞武器”。
他通常看起来没有任何情绪,但向意外发现了他温暖善良的一面。事实上,伊藤曾经有过一段刻骨铭心的恋情,但这段感情的结局太过悲惨,彻底失去了对爱情的信心。翔渐渐爱上了伊藤老师。她用自己的温柔和天真融化了伊藤老师心中的冰,两人终于互相倾诉并开始约会。然而,伊藤老师冷漠的态度经常让翔感到不安。此外,伊藤老师的前情人Mizaki来到向翔的学校,成为一名实习教师。