古怪而沉默的出租车司机Ogogawa与一名女高中生的失踪有关。
所谓S•A班就是special A班，尖子班中的尖子班，只有全年级前七名的精英学生才能进入S•A班。但是光在这里依然打不败全年级第一的彗，还被彗戏谑地称作永远的第二名。除了彗和光，S•A班里还有第三名、第四名的天才音乐家的孩子山本纯（代永翼 配音）和山本芽（高垣彩阳 配音）双胞胎兄妹；第五名的学院理事长的儿子狩野宙（下野紘 配音）；第六名的航空公司社长千金东堂明（生天目仁美 配音）；第七名的体育用品公司社长的儿子辻龙（堀江一真 配音）。光一次次挑战彗的故事还在继续……
Kenshin深深意识到自己和志志雄（藤原龙雄饰演）之间的巨大差距，为了拯救整个日本，他恳请他的主人教他飞天玉参流的最高奥秘。与此同时，熊志智指向东京，采取了武力夺取国家的下一步行动。他迫使伊藤博美（小泽正治饰演）对刽子手高崎发出国家逮捕令，而得知这一消息的阿久间和佐助（青木隆史饰演）则赶往东京。再次上路的《剑心》是第一个被宫廷粉丝领袖森仓子（伊势谷优介饰演）阻挡的人。他一路过关斩将，将与命中注定的对手志志雄展开最后一战。。。这部电影改编自Kazuki Hiroshi的同名经典漫画。
