故事告诉男主角小山武史进入前女子学校Dairi school的故事。在学校的这个女性花园里，小山武正在等待能干的青梅竹马兼学生会副会长、女主人公谷加秋拉、骄傲的小姐神木玲和非常可爱的未婚妻千叶瑞穗。自从巨人出现，人类的和平与幻想破灭的那一天起，艾伦·耶格尔无休止的战斗就没有中断过。在没有任何抵抗的情况下，艾伦看着母亲成为巨人的诱饵，发誓要把巨人一个接一个地赶出这个世界。然而，在残酷的战斗中，他自己也变成了一个巨人。
