前编：诚龙高中为了迎接50周年校庆而打算举办文化祭。在学生会举行的会议上，戏剧部部长莺谷向学生会会长提出了一个建议。为此会长邀请M的五人到他的私人别墅将以超豪华的大餐招待他们。到了那里，M的五人才知道会长的真正用意。
九州的阿苏地区接二连三出现去世的人重返亲人身边的事情，他们保持死亡之前的样子及记忆，为何能够死而复生？调查员川田平太（草剪刚饰）开始调查这个不可思议事件的产生原因。
只有首相山本（石破浩饰）意识到形势的严重性，并任命田所的前妻稻盛浩（毛代一饰）为危机管理大臣，领导田所博士及其团队努力拯救日本。很快，从北海道开始，日本群岛发生了大规模地质灾害，引起了日本全国的恐慌。政府对这场灾难不知所措，唯一的海外移民政策无法应对迅速恶化的局势。日本岛屿完全沉没的现实即将展开。最终，田中博士和他的研究团队终于找到了拯救日本的方法，但这种方法的实际操作充满了困难。。。这部电影改编自日本科幻小说家小松左司的同名畅销小说。这部电影耗资20亿日元，是近年来日本电影业投资最多、推广最广的灾难片。
