随着时间的推移，杨过和小龙女之间渐渐产生了真挚的感情，然而，小龙女深知杨过必须回归江湖，故忍痛离开。 悲痛欲绝的小龙女企图自杀，后被绝情谷谷主公孙止救下。公孙止觊觎小龙女的美貌想要娶她为妻，却遭到了依旧深爱杨过的小龙女的拒绝。愤怒的公孙止刺伤了杨过使其中了奇毒，唯一的解药只存在在绝情谷之中。哪知道半路杀出了公孙止的原配裘千尺，裘千尺告诉杨过，只要他能够杀掉自己的杀兄仇人，便可得到解药，而这仇人竟然正是郭靖夫妇。
鲁邦三世与次元大介为了得到秘宝“小小彗星”潜入东德洛阿。东德洛阿因为本国的著名歌手 玛尔塔在邻国西德洛阿被刺杀而与该国进入一触即发的紧张状态。鲁邦三世与次元大介成功得 到了“小小彗星”，但在逃走时，次元大介被狙击。 是谁狙击了次元大介？为了什么？看到穿过身体的子弹，次元注意到这与在西德洛阿被暗杀的 歌手的子弹是一样的。 次元大介与鲁邦一起来到墓地。两人惊讶地发现那里居然有“次元大介”的坟墓 ！ 从这个信息次元大介推测出犯人，那就是在暗杀前会提前为死者准备坟墓的奥崎，没人能从他 的暗杀下逃出。 鲁邦与次元两人潜入奥崎的秘密小屋，从一间房间的屏幕上看到了被囚禁的不二子！这时，奥 崎出现。 对决的时刻来到了。打破静寂的枪声！被打中的是——！ 再见了，次元……！
1999年，由于数字世界中数据的异常激增，数字世界与现实世界之间的联系被破坏。在地球上，奇怪的自然现象也随之发生：东南亚没有降雨，所有的池塘都干涸了；由于持续的大雨，中东地区发生了洪水；美国遭遇了有史以来最冷的冬天。
