动画剧情舞台为2047年,与人类之敌「D2」对抗而荒废的美国。指挥家「朝雏タクト」与「Musicart」的少女「命运」,在失去音乐的世界中各自为了自身的渴望,共同出发前往纽约。20世纪的最后一个夏天。在那一天,人类终于意识到自己并不是地球的唯一统治者。巨型生物“怪物”和驱逐怪物的终极存在“哥斯拉”出现了。在经历了与怪物长达半个世纪的战争后,人类屡败屡战,最终计划逃离地球。