第2シリーズ。全4話。原作の魔法世界編をもとにしている。OPの絵コンテは赤松健自身が担当。2009年9月15-16日には300名抽選でバンダイチャンネルで第1話の先行ネット試写会が行われる。在新的故事中,神秘动物学的组织“皇帝组织”将勇敢面对这只巨型怪物,强大的哥斯拉也将与门兹拉、拉顿及其死敌基多拉三王展开激烈对抗。当这些传说中的超级生物再次崛起时,他们将进行皇室斗争,人类的命运岌岌可危