表面上看来,真宫樱(井上麻里奈 配音)只是一介平平无奇的女高中生,然而,童年时代的特殊遭遇让她拥有了能够看见幽灵的特异功能,亦改变了她原本风平浪静的生活。
娇小害羞的千濑(前田亚季 饰)一直暗恋着同班同学修次(洼冢俊介 饰),终于,在鼓起勇气向修次表白之后,千濑和修次之间纯白的爱情之花绽放了。一天,札幌的上空突然飞来了大量的轰炸机,战争开始了,也就是从那时起,修次发现了深藏在千濑体内的秘密——向来人畜无害的千濑竟然被军方残忍的改造成为了“最终武器”。 尽管心中充满了恐惧与不忍,但只要遭到了攻击,千濑的身体就会不受控制地做出自卫反击,就这样,在短暂的幸福之后,千濑绝望而又无助的,作为兵器的余生开始了。看着身体和心灵都千疮百孔的女友,修次无法说出宽慰之语,他只能通过行动,默默的陪伴在千濑的身边。
在经过了「女皇之刃 流浪的戰士」以及「女皇之刃 王位的繼承者」,第三季的动画已确定为「女皇之刃 叛乱」,这次的故事可是建基于「女皇之刃」原作的第二系列第一作「叛乱的骑士姬」,所以这次的主角将会是由骑士公主安妮洛特担任。